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TGIRT™-III Enzyme

簡(jiǎn)要描述:TGIRT™-III Enzyme,
酶濃度:
200 單位/微升
單位定義:
一個(gè)單位的 TGIRT

  • 產(chǎn)品型號(hào):
  • 廠商性質(zhì):代理商
  • 更新時(shí)間:2024-01-19
  • 訪  問  量:635

詳細(xì)介紹

品牌其他品牌供貨周期一個(gè)月
應(yīng)用領(lǐng)域醫(yī)療衛(wèi)生,環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),綜合

TGIRT™-III Enzyme

TGIRT™-III Enzyme,描述:


1. 全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。

TGIRT®-seq 的 ribodepleted、碎片化的通用人類參考 RNA 樣本概括了人類轉(zhuǎn)錄本和 spike-ins 的相對(duì)豐度,與非鏈特異性 TruSeq v2 相比,優(yōu)于鏈特異性 Tru-Seq v3。TGIRT®-seq 比 TruSeq v3 具有更高的鏈特異性,并消除了 TruSeq 固有的隨機(jī)六聚體引發(fā)的采樣偏差。TGIRT®-seq 顯示出比 TruSeq 更均勻的 5' 到 3' 基因覆蓋率并識(shí)別出更多的剪接點(diǎn)。TGIRT®-seq 支持在與結(jié)構(gòu)化小 ncRNA(包括 tRNA)相同的 RNA-seq 中同時(shí)分析 mRNA 和 lncRNA,而 tRNA 基本上不存在于 TruSeq 數(shù)據(jù)集中。8個(gè)

2. 全細(xì)胞、外泌體、血漿和其他細(xì)胞外 RNA 的 RNA-seq。

快速處理時(shí)間(通過 PCR 步驟構(gòu)建 RNA-seq 文庫<5 小時(shí));需要少量 RNA(低 ng 范圍);全面的轉(zhuǎn)錄本概況,包括 mRNA 和 lncRNA 以及小 ncRNA,包括 tRNA、pre-miRNA 和其他結(jié)構(gòu)化小 ncRNA 的全長讀數(shù);與傳統(tǒng)方法相比,偏差更小,鏈特異性更高。7,8,15

3. 在 RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP、CRAC、核糖體分析等方法中通過 TGIRT® 模板轉(zhuǎn)換構(gòu)建 RNA-seq 文庫。

快速處理時(shí)間(通過 PCR 步驟構(gòu)建 RNA-seq 文庫 < 5 小時(shí));需要少量 RNA(低 ng 范圍);不需要 RNA 連接酶,通過減少程序中的步驟來減少偏差和提高效率。1,10,11

4. 比逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)合成能力和鏈置換活性。

  • 使用錨定寡核苷酸 (dT) 引物構(gòu)建聚腺苷酸化 RNA 的 RNA-seq 文庫,與沒有核糖核酸去除步驟的逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 相比,其 5' 至 3' 覆蓋范圍更均勻。1個(gè)

  • 通過基于毛細(xì)管電泳的方法(如 SHAPE 或 DMS 結(jié)構(gòu)映射)實(shí)現(xiàn) RNA 結(jié)構(gòu)映射,與逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 相比,讀取長度明顯更長,過早停止更少。1,16

  • 能夠分析包含富含 GC 的重復(fù)擴(kuò)增的 RNA 模板。18

  • 能夠從 tRNA 和其他小的結(jié)構(gòu)化/修飾的 ncRNA 合成全長、端到端的 cDNA,這些 ncRNA 對(duì)逆轉(zhuǎn)錄病毒 RT 具有抵抗力。4-9,12-15    

5. 人血漿和大腸桿菌 基因組DNA 的 ssDNA-seq。

通過直接在 DNA 鏈的 3' 端啟動(dòng) DNA 合成,同時(shí)連接 DNA-seq 適配器,無需末端修復(fù)、加尾或連接,以更簡(jiǎn)單的工作流程捕獲精確的 DNA 末端。能夠分析核小體定位、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)、DNA 甲基化位點(diǎn)和組織來源。

酶的建議用途:

1. 全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。8個(gè)

2. 全細(xì)胞、外泌體、血漿和其他無細(xì)胞 RNA 的 RNA-seq。7,8,15

3. miRNA、tRNA 和其他小的非編碼 RNA 的分析。1-9,12,15

4. RIP-seq、HITS-CLIP、irCLIP 和 CRAC,用于表征 RNA-蛋白質(zhì)相互作用和核糖體分析。1,10,11

5. 通過高通量測(cè)序鑒定 RNA 堿基修飾。4,5,13,14

6. 使用 SHAPE 和 DMS 修飾等方法進(jìn)行全基因組或靶向 RNA 結(jié)構(gòu)作圖。1,16

7. 富含 GC 的重復(fù)擴(kuò)增的逆轉(zhuǎn)錄和定量。18

8. 長 cDNA 的合成。1個(gè)

9. RT-qPCR。1個(gè)

10. 單鏈 DNA 序列。17

11. FFPE 腫瘤樣本分析(咨詢 InGex 技術(shù)支持)。

酶特性和新活性:

  • 比逆轉(zhuǎn)錄病毒逆轉(zhuǎn)錄酶具有更高的熱穩(wěn)定性、持續(xù)合成能力和保真度,允許從高度結(jié)構(gòu)化或大量修飾的 RNA(例如tRNA)和包含富含 GC 的重復(fù)擴(kuò)增的 RNA 合成全長、端到端的 cDNA。1-9,12,15,18

  • 新型端到端模板轉(zhuǎn)換活動(dòng),可在逆轉(zhuǎn)錄過程中連接 RNA-seq 或 PCR 接頭,無需單獨(dú)的 RNA 3'-接頭連接步驟。1這種模板轉(zhuǎn)換活動(dòng)極大地促進(jìn)了鏈特異性 RNA-seq 文庫的構(gòu)建,與使用隨機(jī)六聚體引物或使用 RNA 連接酶進(jìn)行接頭連接的程序相比,偏差更小。1,7,8

  • 從退火引物高效合成 cDNA。退火引物的預(yù)計(jì) Tm應(yīng)>60 o C。建議在室溫下將酶與底物在反應(yīng)混合物中預(yù)孵育 30 分鐘,然后通過添加 dNTP 啟動(dòng)反應(yīng)。應(yīng)通過測(cè)試 25 至 450 mM NaCl 的一系列鹽濃度來確定新應(yīng)用的最佳條件。


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