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用于靶向 DNA 和 RNA 測序的 CleanPlex 擴(kuò)增子測序技術(shù)

更新時間:2024-03-08      點(diǎn)擊次數(shù):257

CleanPlex ®是一種超可擴(kuò)展且超靈敏的NGS 擴(kuò)增子測序技術(shù)。它具有高度先進(jìn)的專有多重 PCR 引物設(shè)計算法、極其均勻的多重 PCR 擴(kuò)增化學(xué)物質(zhì) 和 創(chuàng)新的背景清潔化學(xué)物質(zhì)。它們共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能夠突破傳統(tǒng)的基于擴(kuò)增子和基于混合捕獲的目標(biāo)富集技術(shù)的限制。


功能亮點(diǎn):

  • 超高的擴(kuò)增均勻性和超低的PCR背景噪音(更準(zhǔn)確的變異調(diào)用或更低的測序成本)

  • 單管 3 小時工作流程,手動操作時間最少(輕松自動化)

  • 兼容困難樣品(降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA)和主要測序平臺(Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq)

  • 高的靈敏度(低至單細(xì)胞水平直接擴(kuò)增*)

  • 出色的面板大小可擴(kuò)展性,單個多重 PCR 池中的擴(kuò)增子數(shù)可達(dá) 20,000 多個

  • 檢測和分析單核苷酸變異(SNV)、小插入和缺失(Indels)、拷貝數(shù)變異(CNV)、基因融合/剪接變異、基因表達(dá)水平、腫瘤突變負(fù)荷(TMB)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)、內(nèi)部串聯(lián)復(fù)制(ITD)等

具體來說,擴(kuò)增子測序技術(shù)提供了一種專注于特定基因或特定感興趣基因組區(qū)域的靶向方法。
全基因組測序(WGS)及其相應(yīng)的全基因組擴(kuò)增(WGA)方法更適合研究和發(fā)現(xiàn)類型的應(yīng)用,而靶向測序或靶向基因測序?qū)τ谠S多快速增長的臨床和工業(yè)應(yīng)用至關(guān)重要,這些應(yīng)用的成本和速度都受到限制。更重要。

基因組學(xué)界面臨的挑戰(zhàn)之一是持續(xù)獲取大量測序原始數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)尚未全成功地翻譯和解釋,以幫助在更廣泛的范圍內(nèi)推進(jìn)研究、診斷和治療疾病。即使目前測序成本降低,全基因組測序方法實(shí)際上也只能用于基礎(chǔ)研究、群體遺傳學(xué)或罕見疾病檢測等特定場景。有針對性的或有針對性的方法將更適合了解疾病進(jìn)展并指導(dǎo)臨床環(huán)境中的治療選擇或在工業(yè)應(yīng)用中大規(guī)模篩查 DNA 樣本。此外,就實(shí)驗室操作和用于存儲和處理大量數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施而言,對整個基因組或外顯子組進(jìn)行測序可能非常昂貴。因此,靶向測序?qū)τ诰珳?zhǔn)醫(yī)療和研究的持續(xù)進(jìn)步變得至關(guān)重要。

cleanplex DNA 擴(kuò)增子測序工作流程

圖 2. CleanPlex DNA 靶標(biāo)富集和文庫制備工作流程

cleanplex RNA 靶標(biāo)富集文庫制備工作流程

圖 3. CleanPlex RNA 靶標(biāo)富集和文庫制備工作流程































Paragon Genomics 總部位于舊金山灣區(qū),是一家快速發(fā)展的精準(zhǔn)醫(yī)療公司。我們的靶向測序技術(shù)CleanPlex® DNA、CleanPlex® RNA、CleanPlex® UMIOmniFusion™為精準(zhǔn)腫瘤學(xué)、傳染病檢測、遺傳性疾病檢測、單細(xì)胞分析、分子育種和許多其他應(yīng)用提供全面的解決方案。

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