圖 2:LE220-Plus,樣品體積為 10 µl。結(jié)果顯示,96 AFA-TUBE TPX 板的預(yù)期目標(biāo)尺寸為 150 和 350 bp,每個(gè)重復(fù) 24 個(gè),尺寸分布緊密。
從全血中提取 HMW gDNA
圖 3 :使用高分子量 (>20 Kb) 提取方案在 Covaris truPOP ® Buffer中提取的 gDNA(30 μl 全血)的大小分布圖。在掃描模式下,96 個(gè)樣本的處理時(shí)間為 6 分鐘。
gDNA 片段的窄尺寸分布
圖 4:使用兩種不同的格式和密封選項(xiàng),在 LE220-plus 上剪切后使用片段分析儀對(duì) DNA 進(jìn)行分析。顯示了 8 AFA-TUBE TPX 條和 96 AFA-TUBE 板的 175 bp 和 350 bp 10 µl 的數(shù)據(jù)。結(jié)果顯示所有三種配置均具有較高的重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性。
直接從全血中進(jìn)行高度可重復(fù)的 DNA 片段化
圖 5:圖表顯示了高度可重復(fù)的 DNA 片段化譜(30 μl 全血)和低變異系數(shù)。 DNA 片段大小模式介于 1 和 1.3 kb 之間。通過調(diào)整 AFA 條件(未顯示)可以實(shí)現(xiàn)剪切至 NGS 兼容的片段大小分布(150 至 500 bp)。通過調(diào)整提取緩沖液條件(例如 Covaris 的 truPOP 緩沖液)可以提取高分子量 DNA (40 kb)。對(duì)于 96 AFA-TUBE TPX 板,每列處理時(shí)間為 30 秒。